11 марта 2011 года на японской атомной электростанции «Фукусима-1» произошла крупная радиационная авария. Находкинской таможней был усилен контроль за ввозимыми товарами и транспортными средствами из портов Японии.
Имеющиеся в таможне технические средства таможенного контроля позволяют эффективно проводить радиационный контроль товаров, транспортных средств, международных почтовых отправлений, физических лиц и багажа, прибывающих на таможенную территорию Таможенного союза, в том числе из Японии.
Должностными лицами таможни эксплуатируется 35 стационарных таможенных систем обнаружения делящихся и радиоактивных материалов «Янтарь», а также 111 переносных технических средств. С 2011 года таможней выявлено 124 объекта с повышенным уровнем ионизирующего излучения (автотехника, автомобили, контейнеры с запасными частями). По данным статистики, количество выявляемых таможней товаров с повышенным радиационным фоном существенно уменьшается: в 2011 году — 80 объектов, в 2012 – 30 объектов, в 2013 году – 7 объектов.
В 2014 году должностными лицами таможни было выявлено 6 автомобилей и 1 трактор с повышенным уровнем ионизирующего излучения. Однако в ходе дополнительного радиационного контроля, проведенного совместно со специалистами территориального отдела управления Роспотребнадзора по Приморскому краю в Находке, на поверхности транспортных средств превышений норм радиационной безопасности не выявлено.